29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3940 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3940  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3652  hypothetical protein  58.05 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0991597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2844  sugar isomerase (SIS)  37.1 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3956  sugar isomerase (SIS)  35.82 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612193  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3641  hypothetical protein  45.51 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.511094  normal  0.47359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4895  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.2 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4948  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.2 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4954  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.2 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.28349  normal  0.604519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4794  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  37.2 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0297  sugar isomerase (SIS)  34.3 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5462  sugar isomerase (SIS)  28.77 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0625  sugar isomerase  24.82 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0684  sugar isomerase  24.82 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9146  yurP  26.06 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3473  sugar isomerase (SIS)  25.98 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4683  fructoselysine-6-P-deglycase  26.14 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.791225 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03174  hypothetical protein  25.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0341  sugar isomerase (SIS)  25.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0341  fructoselysine-6-P-deglycase  25.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.782392  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3841  fructoselysine-6-P-deglycase  25.76 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3567  fructoselysine-6-P-deglycase  25.76 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03222  fructoselysine-6-P-deglycase  25.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3707  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  35.53 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3976  sugar isomerase  23.24 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3915  sugar isomerase  22.54 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3795  sugar isomerase  22.54 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.911401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3873  sugar isomerase  22.54 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3807  sugar isomerase  22.54 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1174  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.42 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>