38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3078 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  197  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  98.94 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  63.04 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  45.65 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  45.56 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  44.09 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  43.82 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  43.16 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  47.5 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  41.05 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  46.07 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  41.76 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  42.22 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  41.57 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  38.3 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  45.05 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  45.05 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  42.39 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  38.38 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  40.48 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  34.38 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0451  hypothetical protein  40.58 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  32.95 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0104  hypothetical protein  34.48 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  27.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>