25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0451 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0451  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  221  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  56.58 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  41.86 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  44.74 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  47.92 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  40.58 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  40.58 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  35.14 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  32.43 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  34.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  48.65 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  45.45 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  41.82 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  31.82 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  43.59 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  32.91 
 
 
99 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>