38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  43.96 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  41.76 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  39.56 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  41.94 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  38.46 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  34.04 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  34.04 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  38.46 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  37.36 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  32.61 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  39.58 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  32.58 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  32.26 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  32.26 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  31.87 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  34.65 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  35.87 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  35.87 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  34.78 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  34.38 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  30.11 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0104  hypothetical protein  36.17 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  34.38 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  34.78 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  31.07 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  26.88 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  26.88 
 
 
349 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>