48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0736 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0736  MobC protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.341211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2390  GCN5-related N-acetyltransferase  98.98 
 
 
196 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2454  GCN5-related N-acetyltransferase  84.97 
 
 
196 aa  328  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.250394  normal  0.240064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  50.79 
 
 
202 aa  184  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  44.39 
 
 
207 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117481  normal  0.198643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0428  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.013085  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2690  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.599438  normal  0.339832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.5 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4384  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0795208  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.76 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
162 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  48.21 
 
 
160 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
175 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
244 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  43.75 
 
 
322 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.48 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 
161 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.62 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  40.91 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.06 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2089  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
166 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.89 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4649  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  35 
 
 
369 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.94 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
313 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189304  normal  0.011866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.61 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
162 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
150 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.775511  normal  0.20004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
188 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.35 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1760  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000079668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  32.41 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1576  hypothetical protein  38.18 
 
 
141 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>