37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0428 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0428  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.013085  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2390  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0736  MobC protein  31.4 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.341211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2454  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.250394  normal  0.240064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.4 
 
 
781 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2690  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.599438  normal  0.339832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0676  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  45.45 
 
 
891 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3993  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.93 
 
 
860 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.91 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  35.59 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  38.89 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
381 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  31.3 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
162 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
181 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0181  metalloendopeptidase, glycoprotease family  38.03 
 
 
832 aa  41.2  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
204 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1296  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
204 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
162 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>