98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1552 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2941  hypothetical protein  83.87 
 
 		 62 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.791008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1364  protein of unknown function DUF466  72.41 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.208955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5245  hypothetical protein  56.67 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60930  hypothetical protein  56.67 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41000  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04219  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5865  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4573  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4945  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4879  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3713  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4893  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3644  protein of unknown function DUF466  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0023  hypothetical protein  57.38 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04185  hypothetical protein  58.33 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4882  hypothetical protein  61.67 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3225  protein of unknown function DUF466  57.63 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1090  hypothetical protein  57.63 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.926383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4637  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0581  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1293  hypothetical protein  58.49 
 
 		 785 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0961  protein of unknown function DUF466  57.63 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0260  hypothetical protein  59.62 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4272  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4937  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.793617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4784  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4885  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4858  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4944  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.786101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0799  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4502  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4634  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2938  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.888037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3064  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4640  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4711  hypothetical protein  59.26 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5299  hypothetical protein  59.26 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5433  hypothetical protein  59.26 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2251  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4227  hypothetical protein  58.82 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3416  hypothetical protein  57.41 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0510  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2450  hypothetical protein  54.1 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.974408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6472  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  0.210548 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3246  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710671  normal  0.40045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0098  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1262  hypothetical protein  53.7 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3573  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0959  protein of unknown function DUF466  52.54 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02025  hypothetical protein  57.41 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3726  protein of unknown function DUF466  55.56 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7758  hypothetical protein  56.86 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3403  protein of unknown function DUF466  58.82 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0501  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00555  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0684  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3045  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3026  protein of unknown function DUF466  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0619  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.593991  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00566  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0650  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0619  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1024  hypothetical protein  53.7 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3981  protein of unknown function DUF466  54.9 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.255215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1131  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5595  hypothetical protein  40.3 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3928  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2016  hypothetical protein  47.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2293  protein of unknown function DUF466  47.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1978  protein of unknown function DUF466  47.54 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89356  normal  0.275642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5095  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5544  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5268  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1404  protein of unknown function DUF466  48 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5665  hypothetical protein  44 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.853434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5539  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.646832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5510  hypothetical protein  44 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5112  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0599  protein of unknown function DUF466  48 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0830436  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1187  protein of unknown function DUF466  47.17 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00439042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2988  protein of unknown function DUF466  53.57 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.871096  normal  0.0391421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5209  hypothetical protein  44 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4535  hypothetical protein  45.9 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108397  normal  0.640531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5412  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2628  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4340  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.20425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1907  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.063511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2242  hypothetical protein  44 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2018  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0752714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2943  hypothetical protein  45.9 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.077188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4190  protein of unknown function DUF466  44.26 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1349  conserved hypothetical protein (DUF466 domain protein)  34.48 
 
 		 63 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>