23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2132 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  75.76 
 
 		 133 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  53.03 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  49.24 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  51.52 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  47.73 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  47.33 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  42.75 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  36.92 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  45.8 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  29.32 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  29.32 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  31.79 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  31.33 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  25.56 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2539  hypothetical protein  39.29 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00977355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  24.09 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  26.9 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  26.9 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>