11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2539 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00977355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  58 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  40.58 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  40 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  39.29 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  37.7 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  39.29 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  38.98 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  39.66 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>