88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0119 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0119  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  293  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2940  hypothetical protein  41.13 
 
 
157 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
159 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0846  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.75 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.502759  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0561  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0558  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4027  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3967  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0821  PhnB  27.91 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.697447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4461  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162463  normal  0.621639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4843  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.17 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
418 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0996  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
372 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1024  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
418 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1265  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2462  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2960  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0107  hypothetical protein  28.7 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1175  glyoxalase family protein  26.36 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10904  hypothetical protein  31.9 
 
 
170 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.83 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0294662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5027  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 
421 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0265  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2240  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.19 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.690904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0854  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
438 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0517095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5689  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.774058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3435  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3647  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1424  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.805233  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
155 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219194  normal  0.368247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1723  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
153 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1768  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.610611  normal  0.194183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0636  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0865  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.19 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1193  glyoxalase family protein  36.13 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0244089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0922  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747908  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2580  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0814161  normal  0.0105552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3720  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.989222  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1601  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0389158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0603  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1220  glyoxalase family protein  33.87 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3975  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4559  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.45 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0560  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.25 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1292  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
377 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
157 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.254245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2755  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5523  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.982218  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3610  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4084  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484555  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4221  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0959  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211935  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4446  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.45 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.45 
 
 
147 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0962  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.87 
 
 
156 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000836604  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0536  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase family protein  33.33 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3471  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3434  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5810  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550364  normal  0.497297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3444  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1583  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1560  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1644  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3318  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4058  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3241  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.656661  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0500  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.19 
 
 
245 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>