10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_R0016 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_R0016    100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634064  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0045    92.16 
 
 		 106 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00980767  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0027    93.62 
 
 		 96 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0644727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0029    92.16 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0027    92.16 
 
 		 104 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0049    92 
 
 		 91 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0054    93.33 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1349  hypothetical protein  91.84 
 
 		 312 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182207  normal  0.0354453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA5  gcvT  93.18 
 
 		 107 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0042    94.12 
 
 		 106 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>