12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0187 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  202  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5232  hypothetical protein  75.53 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5141  hypothetical protein  75.53 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5293  hypothetical protein  91.3 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0240  hypothetical protein  89.86 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.412308  normal  0.748939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0220  hypothetical protein  90.59 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69770  hypothetical protein  73.63 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298541  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0262  hypothetical protein  72.38 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.961659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5503  hypothetical protein  96.49 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47760  hypothetical protein  79.1 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0684426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6027  hypothetical protein  68.13 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0235  hypothetical protein  58 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>