12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0262 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  202  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.961659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69770  hypothetical protein  78.5 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298541  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6027  hypothetical protein  81.05 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5232  hypothetical protein  76.29 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5141  hypothetical protein  76.29 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47760  hypothetical protein  76.47 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0684426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5503  hypothetical protein  62.62 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5293  hypothetical protein  88.89 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0240  hypothetical protein  86.76 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.412308  normal  0.748939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0220  hypothetical protein  89.47 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0187  hypothetical protein  89.47 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0235  hypothetical protein  58 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>