13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0235 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5503  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0262  hypothetical protein  58 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.961659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5232  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5141  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6027  hypothetical protein  58 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0220  hypothetical protein  58 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69770  hypothetical protein  58 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298541  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5293  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0240  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.412308  normal  0.748939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0187  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47760  hypothetical protein  54 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0684426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3579  hypothetical protein  41.46 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>