21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2056 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2056  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3712  hypothetical protein  97.56 
 
 
164 aa  326  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2226  hypothetical protein  89.02 
 
 
164 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2230  GCN5-related N-acetyltransferase  78.05 
 
 
164 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.562573  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0755  acetyltransferase-like protein  62.96 
 
 
164 aa  206  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2576  acetyltransferase  34.29 
 
 
168 aa  84.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000148974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1411  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2986  hypothetical protein  25.9 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1373  acetyltransferase  30.22 
 
 
162 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1308  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
163 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1264  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1171  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4036  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1334  acetyltransferase, GNAT family  29.5 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67457e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1145  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1151  acetyltransferase  28.78 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2109  hypothetical protein  27.74 
 
 
336 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  20.59 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0663148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7066  acetyltransferase-like protein  28.69 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>