21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2226 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2056  hypothetical protein  89.02 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3712  hypothetical protein  88.41 
 
 		 164 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2230  GCN5-related N-acetyltransferase  76.22 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0755  acetyltransferase-like protein  63.58 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2576  acetyltransferase  31.72 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000148974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1411  acetyltransferase, GNAT family  29.68 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4036  acetyltransferase, GNAT family  27.74 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1373  acetyltransferase  28.21 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1264  acetyltransferase  29.3 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1171  acetyltransferase  29.3 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1334  acetyltransferase, GNAT family  29.3 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67457e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2986  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1145  acetyltransferase  29.3 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1308  acetyltransferase, GNAT family  26.92 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1151  acetyltransferase  28.66 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2109  hypothetical protein  27.74 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  22.52 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0663148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7066  acetyltransferase-like protein  30.39 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>