21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3712 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3712  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2056  hypothetical protein  97.56 
 
 
164 aa  326  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2226  hypothetical protein  88.41 
 
 
164 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2230  GCN5-related N-acetyltransferase  78.66 
 
 
164 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.562573  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0755  acetyltransferase-like protein  64.2 
 
 
164 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2576  acetyltransferase  33.57 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000148974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2986  hypothetical protein  27.34 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1411  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1373  acetyltransferase  31.54 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1308  acetyltransferase, GNAT family  28.68 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1264  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1171  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1334  acetyltransferase, GNAT family  29.5 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67457e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4036  acetyltransferase, GNAT family  27.54 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1145  acetyltransferase  29.5 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1151  acetyltransferase  28.78 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2109  hypothetical protein  26.28 
 
 
336 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7066  acetyltransferase-like protein  29.51 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640033  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  21.9 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0663148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>