10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2096 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.413593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3795  hypothetical protein  51.01 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1974  hypothetical protein  49.66 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2121  hypothetical protein  51.37 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460411  hitchhiker  0.00638074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2614  hypothetical protein  32.5 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00337391  normal  0.53765 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6566  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7537  hypothetical protein  42.71 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2499  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0165964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>