12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6082 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6082  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  296  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5718  hypothetical protein  99.38 
 
 
160 aa  294  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6566  hypothetical protein  96.88 
 
 
160 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7537  hypothetical protein  72.5 
 
 
155 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6101  hypothetical protein  63.12 
 
 
151 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69699  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5862  hypothetical protein  64.6 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454154  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6009  hypothetical protein  69.81 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2096  hypothetical protein  37.21 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.413593  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1974  hypothetical protein  38.39 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3795  hypothetical protein  36.61 
 
 
148 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2121  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460411  hitchhiker  0.00638074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2499  hypothetical protein  42.31 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0165964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>