10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3186 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63660  hypothetical protein  54.57 
 
 		 411 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001115  hypothetical protein  32.67 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06671  hypothetical protein  31.94 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4287  hypothetical protein  29.81 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637696  normal  0.308708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1404  hypothetical protein  29.06 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2879  hypothetical protein  29.28 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000019953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5535  hypothetical protein  65.15 
 
 		 122 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5452  hypothetical protein  27.85 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  38.54 
 
 		 589 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>