14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1627 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1627  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 53 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2214  transposase IS111A/IS1328/IS1533  57.78 
 
 		 430 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1530  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.11 
 
 		 412 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4852  ISCps5, transposase  37.25 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1409  ISCps4, transposase  48.89 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3059  ISCps4, transposase  48.89 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3321  ISCps4, transposase  48.89 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  62.86 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>