14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0500 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000708354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  57.07 
 
 
189 aa  221  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  48.65 
 
 
184 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000238688  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  44.32 
 
 
181 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  42.54 
 
 
184 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  40.33 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  40.44 
 
 
185 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  32.71 
 
 
246 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  32.24 
 
 
241 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  47.25 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  40 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  24.26 
 
 
202 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>