18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0102 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000238688  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  75.27 
 
 
181 aa  286  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  62.7 
 
 
184 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  53.89 
 
 
189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  53.76 
 
 
186 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  52.97 
 
 
185 aa  200  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  48.65 
 
 
205 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000708354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  33.15 
 
 
177 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  30.37 
 
 
246 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  31.19 
 
 
237 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  30.56 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  29.67 
 
 
241 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  35.23 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  26.44 
 
 
202 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3343  hypothetical protein  36.14 
 
 
541 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3424  hypothetical protein  34.94 
 
 
543 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.163574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3488  hypothetical protein  34.94 
 
 
543 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1904  hypothetical protein  29.51 
 
 
559 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>