19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0092 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  90.32 
 
 		 185 aa  347  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  57.22 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  53.76 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000238688  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  42.78 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  40.33 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000708354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  30.69 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  34.25 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  28.23 
 
 		 241 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  23.15 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1904  hypothetical protein  32.91 
 
 		 559 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3424  hypothetical protein  31.88 
 
 		 543 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.163574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3488  hypothetical protein  31.88 
 
 		 543 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3343  hypothetical protein  32.89 
 
 		 541 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3409  hypothetical protein  31.58 
 
 		 545 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0767793  normal  0.404004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>