28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0459 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2852  putative ATPase  100 
 
 
276 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2274  putative ATPase  100 
 
 
276 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2124  putative ATPase  100 
 
 
276 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1331  putative ATPase  100 
 
 
276 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1321  putative ATPase  100 
 
 
310 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0943  putative ATPase  100 
 
 
276 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0459  hypothetical protein  100 
 
 
44 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2009  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182844  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2406  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000114906  decreased coverage  0.00000352563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2551  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.082817  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2836  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3141  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3930  type II general secretion pathway ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00167468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4423  type II general secretion pathway ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00207936  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5479  type II general secretion pathway ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0903611  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1999  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0320  ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.516384 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6336  type II general secretion pathway ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000121013  hitchhiker  0.0000465565 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5942  type II general secretion pathway ATPase  51.22 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00622047  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7426  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.6356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0129  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7259  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0098  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1121  putative general secretion pathway protein, ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6581  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.0159835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6465  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5182  AAA ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0709  putative ATPase  55.26 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>