15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2726 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2726  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2352  hypothetical protein  61.35 
 
 
203 aa  270  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0120  hypothetical protein  60.87 
 
 
210 aa  268  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0187  hypothetical protein  58.45 
 
 
225 aa  256  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2738  hypothetical protein  58.45 
 
 
207 aa  257  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0239  hypothetical protein  57 
 
 
207 aa  256  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2003  hypothetical protein  56.25 
 
 
200 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0273  hypothetical protein  53.62 
 
 
207 aa  239  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0118  hypothetical protein  29.74 
 
 
203 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0082  hypothetical protein  32.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0981186  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0095  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000118998  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0074  hypothetical protein  29.9 
 
 
203 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2683  hypothetical protein  31.31 
 
 
203 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0077  hypothetical protein  28.93 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0011  hypothetical protein  27.32 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.986898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>