15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0077 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0077  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0082  hypothetical protein  68.97 
 
 
203 aa  315  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0981186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2683  hypothetical protein  68.53 
 
 
203 aa  305  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0074  hypothetical protein  62.56 
 
 
203 aa  289  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0011  hypothetical protein  63.13 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.986898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0118  hypothetical protein  57.64 
 
 
203 aa  266  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0095  hypothetical protein  48.5 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000118998  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0239  hypothetical protein  31.66 
 
 
207 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2352  hypothetical protein  31 
 
 
203 aa  101  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0273  hypothetical protein  28.29 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0187  hypothetical protein  31.28 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2738  hypothetical protein  31.28 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2726  hypothetical protein  28.93 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0120  hypothetical protein  29.06 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2003  hypothetical protein  30.1 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>