15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2352 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2352  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2003  hypothetical protein  66.67 
 
 
200 aa  287  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0239  hypothetical protein  63.77 
 
 
207 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2726  hypothetical protein  61.35 
 
 
207 aa  270  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0187  hypothetical protein  55.56 
 
 
225 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2738  hypothetical protein  55.56 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0273  hypothetical protein  53.14 
 
 
207 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0120  hypothetical protein  44.66 
 
 
210 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0118  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0082  hypothetical protein  36.04 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0981186  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0095  hypothetical protein  34.18 
 
 
200 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000118998  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0074  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2683  hypothetical protein  31.03 
 
 
203 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0077  hypothetical protein  31 
 
 
203 aa  101  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0011  hypothetical protein  29 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.986898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>