20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1928 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1928  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  76.36 
 
 
299 aa  163  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  78.43 
 
 
288 aa  153  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1937  hypothetical protein  33.65 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.869802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  34.34 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  32.39 
 
 
259 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  44.19 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  35.9 
 
 
317 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  34.52 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  31.07 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  31.07 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  30.1 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  28.42 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2697  hypothetical protein  34.85 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  34.62 
 
 
340 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  33.8 
 
 
312 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  39.58 
 
 
318 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  36.17 
 
 
300 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  28 
 
 
302 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>