13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1332 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1332  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.296436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0151  hypothetical protein  70.31 
 
 
133 aa  203  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000068348  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2508  hypothetical protein  71.09 
 
 
130 aa  200  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000103453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0118  hypothetical protein  60.94 
 
 
134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.846623  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0162  hypothetical protein  61.72 
 
 
130 aa  180  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000320706  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0167  hypothetical protein  62.5 
 
 
130 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000448759  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0233  hypothetical protein  57.03 
 
 
130 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0617  hypothetical protein  53.49 
 
 
130 aa  157  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2028  hypothetical protein  51.56 
 
 
130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000289576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1732  hypothetical protein  47.29 
 
 
129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0766  hypothetical protein  47.66 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0196  hypothetical protein  42.52 
 
 
138 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2028  hypothetical protein  46.51 
 
 
130 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0133022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>