13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0196 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0196  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0638518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0151  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000068348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0233  hypothetical protein  50.41 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2508  hypothetical protein  52.5 
 
 
130 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000103453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0118  hypothetical protein  46.09 
 
 
134 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.846623  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1332  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.296436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2028  hypothetical protein  43.31 
 
 
130 aa  123  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000289576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0162  hypothetical protein  46.67 
 
 
130 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000320706  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0167  hypothetical protein  45.76 
 
 
130 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000448759  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0617  hypothetical protein  40.68 
 
 
130 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2028  hypothetical protein  51.64 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0133022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1732  hypothetical protein  38.89 
 
 
129 aa  100  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0766  hypothetical protein  38.71 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>