13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0454 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  323  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1213  hypothetical protein  59.02 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5397  hypothetical protein  69.23 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1588  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2819  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3098  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4400  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0287  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3967  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0377949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5269  hypothetical protein  45.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 548 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 548 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5395  hypothetical protein  48.15 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>