14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1256 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  29.17 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  29.17 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  28.7 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  28.7 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  30.95 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2253  hypothetical protein  23.74 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847078  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  35.96 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0543  hypothetical protein  25.68 
 
 		 350 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.579858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  32.58 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>