32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0747 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0747  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0835  hypothetical protein  69.19 
 
 		 173 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1272  hypothetical protein  50.91 
 
 		 163 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0527391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4214  hypothetical protein  51.08 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1119  putative lipoprotein  40.48 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.195336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0513  hypothetical protein  36.03 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0488  hypothetical protein  36.03 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.380914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0646  putative lipoprotein  37.82 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000213359  normal  0.146411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0555  hypothetical protein  35.46 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00222948  hitchhiker  0.00153836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3670  hypothetical protein  36.88 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0585  hypothetical protein  35.46 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0945656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2798  hypothetical protein  36.03 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0103  hypothetical protein  35.46 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0198  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1229  hypothetical protein  31.65 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000243549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0511  putative lipoprotein  40.91 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31977  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1844  putative lipoprotein  38.24 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0351811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0441  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1300  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3485  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3522  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3263  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2519  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0879276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1144  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3520  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.214963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2648  CNP1-like protein of unknown function  40.91 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3445  hypothetical protein  46.25 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00424122  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3063  hypothetical protein  44.94 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3102  hypothetical protein  31.65 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2818  putative lipoprotein  50.7 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0124705  normal  0.224694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2653  hypothetical protein  46.75 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00481564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2954  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.818118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>