11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3529 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  277  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00257659  normal  0.365119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0987  hypothetical protein  51.72 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14450  hypothetical protein  50.68 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1269  hypothetical protein  46.05 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1280  hypothetical protein  49.25 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0984  hypothetical protein  45.77 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1089  hypothetical protein  44.97 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11630  hypothetical protein  44.22 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4239  hypothetical protein  45.07 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1016  hypothetical protein  43.66 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0978  hypothetical protein  42.96 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278935  normal  1 
 
 
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