11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0978 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1016  hypothetical protein  99.17 
 
 		 121 aa  230  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0984  hypothetical protein  91.74 
 
 		 121 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4239  hypothetical protein  84 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0987  hypothetical protein  58.78 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1269  hypothetical protein  52.17 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1089  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3529  hypothetical protein  42.25 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00257659  normal  0.365119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1280  hypothetical protein  47.75 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14450  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11630  hypothetical protein  45.38 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>