11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1269 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1089  hypothetical protein  75.69 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0987  hypothetical protein  62.94 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0984  hypothetical protein  54.89 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0978  hypothetical protein  53.28 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1016  hypothetical protein  54.14 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4239  hypothetical protein  52.63 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3529  hypothetical protein  45.58 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00257659  normal  0.365119 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1280  hypothetical protein  46.56 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_14450  hypothetical protein  41.55 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_11630  hypothetical protein  39.72 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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