15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0979 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0693  hypothetical protein  86.32 
 
 		 943 aa  1632    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0988  hypothetical protein  86.54 
 
 		 939 aa  1632    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0853  hypothetical protein  86.75 
 
 		 939 aa  1636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.955255  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4779  hypothetical protein  87.26 
 
 		 946 aa  1628    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61990  hypothetical protein  87.24 
 
 		 948 aa  1628    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0499759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0979  hypothetical protein  100 
 
 		 943 aa  1904    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0725  hypothetical protein  85.82 
 
 		 931 aa  1603    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234554  normal  0.0506019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5393  hypothetical protein  87.55 
 
 		 948 aa  1631    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0725  hypothetical protein  86.32 
 
 		 943 aa  1630    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4492  hypothetical protein  87.27 
 
 		 943 aa  1643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104208  normal  0.384908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1265  hypothetical protein  27.97 
 
 		 930 aa  326  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3600  hypothetical protein  28.36 
 
 		 917 aa  296  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4443  hypothetical protein  28.87 
 
 		 946 aa  282  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1671  hypothetical protein  45.76 
 
 		 99 aa  55.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2520  hypothetical protein  29.7 
 
 		 980 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>