11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1671 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0988  hypothetical protein  47.46 
 
 		 939 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0853  hypothetical protein  47.46 
 
 		 939 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.955255  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0979  hypothetical protein  45.76 
 
 		 943 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4779  hypothetical protein  47.46 
 
 		 946 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61990  hypothetical protein  45.76 
 
 		 948 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0499759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5393  hypothetical protein  45.76 
 
 		 948 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0725  hypothetical protein  47.46 
 
 		 943 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4492  hypothetical protein  47.46 
 
 		 943 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104208  normal  0.384908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0693  hypothetical protein  45.76 
 
 		 943 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0725  hypothetical protein  45.76 
 
 		 931 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234554  normal  0.0506019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>