14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4443 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4443  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3600  hypothetical protein  55.09 
 
 		 917 aa  906    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1265  hypothetical protein  50.22 
 
 		 930 aa  887    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0979  hypothetical protein  28.57 
 
 		 943 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0988  hypothetical protein  28.19 
 
 		 939 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0693  hypothetical protein  27.69 
 
 		 943 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0853  hypothetical protein  27.87 
 
 		 939 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.955255  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0725  hypothetical protein  27.8 
 
 		 943 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5393  hypothetical protein  27.45 
 
 		 948 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61990  hypothetical protein  27.45 
 
 		 948 aa  262  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0499759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0725  hypothetical protein  27.47 
 
 		 931 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234554  normal  0.0506019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4492  hypothetical protein  27.33 
 
 		 943 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104208  normal  0.384908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4779  hypothetical protein  27.43 
 
 		 946 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2188  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1003 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>