12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2484 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2484  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235294  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1884  hypothetical protein  42.21 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4998  hypothetical protein  44.98 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0489  hypothetical protein  39.93 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3165  hypothetical protein  40.43 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1979  hypothetical protein  46.61 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0621  hypothetical protein  42.65 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218672  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3148  hypothetical protein  43.08 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3384  hypothetical protein  34.31 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.213677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0715  hypothetical protein  40.24 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0409  hypothetical protein  30.87 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  36.25 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>