26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1554 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1554  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 64 aa  131  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  48.15 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  39.66 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4547  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  38.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  40.68 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  40.82 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  42.31 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  34.55 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  34.55 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2498  hypothetical protein  38.78 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0116  putative stability protein StbD  44.44 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000696013  normal  0.795005 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  29.82 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0318  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.07108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1587  hypothetical protein  27.59 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  31.03 
 
 		 83 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3375  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 96 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>