40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0318 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0318  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 84 aa  170  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.07108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1656  putative stability protein StbD  65.48 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1618  putative stability protein StbD  65.48 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.602129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1722  putative stability protein StbD  65.48 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.139428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0116  putative stability protein StbD  63.1 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000696013  normal  0.795005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0795  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.56654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0822  hypothetical protein  48.81 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.556624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00612  hypothetical protein  53.33 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0889  stability protein StbD, putative  51.19 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4315  hypothetical protein  48.53 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135355  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1011  protein of unknown function DUF172  51.19 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164621  hitchhiker  0.000000000602107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4184  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3850  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000226334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0154  prevent-host-death protein  46.43 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4837  prevent-host-death family protein  44.05 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5383  prevent-host-death family protein  44.05 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.580876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1470  hypothetical protein  52.78 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1587  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4768  prevent-host-death family protein  44.05 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2257  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000344614  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3687  prevent-host-death family protein  48.81 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726516  normal  0.144685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3784  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1120  prevent-host-death protein  40 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0992738  normal  0.192067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1265  StbD-like prevent host death protein  40 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44990  Prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0003  antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family  36.76 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0090  hypothetical protein  39.19 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2747  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3832  prevent-host-death protein  35.44 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0245  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4547  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1651  prevent-host-death protein  33.75 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0709  hypothetical protein  32.5 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3375  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0955  protein of unknown function DUF172  31.25 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0517  primosomal protein DnaI  43.14 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1554  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5875  primosomal protein DnaI  38.24 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000199984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3693  primosomal protein DnaI  37.93 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000682768  hitchhiker  0.0041553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>