12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1979 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1979  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  189  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.480711  hitchhiker  0.000474126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1172  hypothetical protein  52.04 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444797  normal  0.141537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0069  hypothetical protein  54.79 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185594  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2039  hypothetical protein  44.9 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000729193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1706  hypothetical protein  47.5 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.189482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1269  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0068  hypothetical protein  41.41 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.21828  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0969  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1783  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  0.894771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0324  hypothetical protein  37.25 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0389655  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1448  hypothetical protein  45.88 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.499553  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1419  hypothetical protein  37.35 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00933773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>