13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2039 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2039  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000729193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0068  hypothetical protein  63.64 
 
 
127 aa  150  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.21828  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1172  hypothetical protein  40.68 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444797  normal  0.141537 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1979  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.480711  hitchhiker  0.000474126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1706  hypothetical protein  38.53 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.189482  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0969  hypothetical protein  35.9 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0069  hypothetical protein  51.56 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185594  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1783  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  0.894771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1269  hypothetical protein  30.09 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1448  hypothetical protein  42.35 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.499553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0324  hypothetical protein  30.61 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0389655  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1419  hypothetical protein  33.65 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00933773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2978  hypothetical protein  33 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317286  normal  0.562882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>