12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1172 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1172  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  220  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444797  normal  0.141537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0069  hypothetical protein  70.27 
 
 
78 aa  102  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185594  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1979  hypothetical protein  52.04 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.480711  hitchhiker  0.000474126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2039  hypothetical protein  40.68 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000729193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1706  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.189482  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1783  hypothetical protein  38.46 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  0.894771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0969  hypothetical protein  39.32 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1269  hypothetical protein  34.82 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0068  hypothetical protein  44.92 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.21828  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1419  hypothetical protein  38.24 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00933773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0324  hypothetical protein  37.76 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0389655  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1448  hypothetical protein  36.04 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.499553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>