48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0060 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0060  transcriptional repressor protein MetJ  100 
 
 		 96 aa  201  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0897621  normal  0.262444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3552  transcriptional repressor protein MetJ  84.78 
 
 		 104 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.325216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0614  transcriptional repressor protein MetJ  81.72 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0519  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3172  transcriptional repressor protein MetJ  83.7 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3615  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.902185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4430  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4433  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4316  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4346  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4500  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4424  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.93881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0621  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4173  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4478  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4042  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03824  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4380  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.765352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4077  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5398  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.589642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03773  hypothetical protein  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.522699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4047  methionine repressor, MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4057  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0559  transcriptional repressor protein MetJ  81.52 
 
 		 104 aa  163  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0511  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3440  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0119  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4787  transcriptional repressor protein MetJ  80.85 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0120  transcriptional repressor protein MetJ  80.85 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4096  transcriptional repressor protein MetJ  80.85 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002304  methionine repressor MetJ  84.44 
 
 		 106 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0188  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0176  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3792  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0615  transcriptional repressor protein MetJ  83.7 
 
 		 104 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3777  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0563  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0535  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0559  transcriptional repressor protein MetJ  82.61 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00050  transcriptional repressor protein MetJ  83.33 
 
 		 106 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3808  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4036  transcriptional repressor protein MetJ  79.79 
 
 		 105 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2255  transcriptional repressor protein MetJ  83.33 
 
 		 105 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2746  transcriptional repressor protein MetJ  82.22 
 
 		 106 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3956  transcriptional repressor protein MetJ  75.79 
 
 		 107 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0454  transcriptional repressor protein MetJ  76.34 
 
 		 109 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03523  transcriptional repressor protein MetJ  71.28 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0469  transcriptional repressor protein MetJ  77.17 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.753139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>