49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3214 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3214  FeS assembly protein IscX  100 
 
 		 80 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.756518  normal  0.139511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0478  hypothetical protein  41.1 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0679  hypothetical protein  42.42 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0828  FeS assembly protein IscX  42.42 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0346941  normal  0.584333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1065  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1031  hypothetical protein  45.31 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0581  hypothetical protein  42.25 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0641  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0901952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1920  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.936789  normal  0.847622 
 
 
-
 
NC_002978  WD0389  hypothetical protein  46.97 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3056  hypothetical protein  40.91 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00735803  hitchhiker  0.00000912213 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0559  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.589657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0547  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1782  FeS assembly protein IscX  41.18 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000715964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2142  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000760105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0723  iron-sulfur cluster assembly protein  39.13 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2825  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1956  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.453681  normal  0.885386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1746  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1826  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000390738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2271  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2273  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000561979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2863  hypothetical protein  35.21 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.992036  hitchhiker  0.0000000169908 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1170  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.740176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1559  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0560474  normal  0.22118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1452  FeS assembly protein IscX  39.06 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0633  FeS assembly protein IscX  40.91 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0599  hypothetical protein  40.91 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0624  FeS assembly protein IscX  40.91 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2573  FeS assembly protein IscX  39.06 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.259531  normal  0.014993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2311  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1496  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2495  hypothetical protein  36.76 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000113694  hitchhiker  0.00873883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0138645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2379  hypothetical protein  36.76 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000668303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0283  hypothetical protein  36.92 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2390  hypothetical protein  36.76 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000989669  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0197  hypothetical protein  38.03 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.516503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1968  FeS assembly protein IscX  36.76 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221322  hitchhiker  0.000331395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004354  hypothetical protein  34.85 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2199  FeS assembly protein IscX  31.58 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.750509  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1026  hypothetical protein  35.82 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4606  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0908  hypothetical protein  40.58 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0956  FeS assembly protein IscX  35.94 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148069  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0891  FeS assembly protein IscX  35.94 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651068  normal  0.0428371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1881  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>