18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0162 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  44.23 
 
 		 266 aa  238  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  35.32 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0244  S1/P1 nuclease  33.72 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  31.27 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  31.5 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  33.14 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  29.51 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  26.77 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  27.84 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  25.98 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  31.28 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  27.56 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  27.47 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  24.82 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02540  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  25.37 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  24.52 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>