53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3324 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3259  hypothetical protein  53.95 
 
 		 79 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0385261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17960  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1872  hypothetical protein  51.39 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0467  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3478  hypothetical protein  49.33 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3103  hypothetical protein  49.35 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.826821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01749  hypothetical protein  46.05 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.999492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0270  hypothetical protein  45.57 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0226  hypothetical protein  45.57 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3042  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035425  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2043  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1356  hypothetical protein  44.74 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3847  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.52304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0169  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.624405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0223  hypothetical protein  41.77 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1091  hypothetical protein  42.67 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2186  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1480  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.154498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3564  hypothetical protein  44.87 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0499  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1125  hypothetical protein  39.47 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1762  hypothetical protein  43.06 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1254  hypothetical protein  39.19 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2483  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2955  hypothetical protein  44.93 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.874724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28460  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3397  hypothetical protein  44.93 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2706  hypothetical protein  43.42 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0979875  normal  0.692275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1518  hypothetical protein  38.16 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1896  hypothetical protein  45.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2649  hypothetical protein  39.19 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2730  hypothetical protein  41.43 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185514  unclonable  0.000000114972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2121  hypothetical protein  38.96 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3189  hypothetical protein  41.33 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.3436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2830  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2656  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2723  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2247  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.886645  normal  0.845436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3313  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002715  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1334  hypothetical protein  33.77 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1613  hypothetical protein  32.89 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1466  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1430  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2918  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.67882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1436  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.995691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3295  hypothetical protein  34.21 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01019  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00266813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2897  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3925  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.912444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3174  hypothetical protein  30.26 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1029  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0015753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>